Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer1Q9CQL2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer1Q9CQL2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms