Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rdm1Q9CQK3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rdm1Q9CQK3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms