Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufb9Q9CQJ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms