Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Higd2aQ9CQJ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd2aQ9CQJ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Higd2aQ9CQJ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd2aQ9CQJ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd2aQ9CQJ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms