Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpd52l3Q9CQ14 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpd52l3Q9CQ14 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpd52l3Q9CQ14 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms