Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep41Q99NF3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms