Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atoh8Q99NA2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atoh8Q99NA2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms