Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4dQ99N05 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms