Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel1Q99MW3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms