Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd3Q99MJ6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd3Q99MJ6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd3Q99MJ6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms