Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clp1Q99LI9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms