Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cstf3Q99LI7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms