Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnpo2Q99LG2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms