Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp16Q99LG0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp16Q99LG0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms