Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ciao1Q99KN2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ciao1Q99KN2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms