Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp11Q99K46 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms