Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mcoln1Q99J21 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln1Q99J21 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms