Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cldn16Q925N4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn16Q925N4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cldn16Q925N4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cldn16Q925N4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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