Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbox1Q924Y0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbox1Q924Y0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbox1Q924Y0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbox1Q924Y0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbox1Q924Y0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbox1Q924Y0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbox1Q924Y0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbox1Q924Y0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbox1Q924Y0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bbox1Q924Y0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbox1Q924Y0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms