Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csmd1Q923L3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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