Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp4Q921I6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms