Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab29Q91YQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Rab29Q91YQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Rab29Q91YQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Rab29Q91YQ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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Rab29Q91YQ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab29Q91YQ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms