Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha9Q91Y11 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha9Q91Y11 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms