Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ5

Pqbp1, Polyglutamine-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pqbp1Q91VJ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pqbp1Q91VJ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pqbp1Q91VJ5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms