Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hps3Q91VB4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps3Q91VB4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms