Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp25Q8VIK1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms