Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgbl1Q8VDV0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgbl1Q8VDV0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgbl1Q8VDV0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgbl1Q8VDV0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgbl1Q8VDV0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms