Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg12Q8VDB2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alg12Q8VDB2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms