Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c5Q8R2T8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms