Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc3Q8K3W3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc3Q8K3W3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc3Q8K3W3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms