Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccm2Q8K2Y9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccm2Q8K2Y9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms