Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FgbQ8K0E8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FgbQ8K0E8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms