Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klre1Q8CJC7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klre1Q8CJC7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klre1Q8CJC7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klre1Q8CJC7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klre1Q8CJC7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klre1Q8CJC7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms