Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TwnkQ8CIW5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwnkQ8CIW5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwnkQ8CIW5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms