Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc45Q8CIM1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc45Q8CIM1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lrrc45Q8CIM1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc45Q8CIM1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc45Q8CIM1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc45Q8CIM1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc45Q8CIM1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc45Q8CIM1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc45Q8CIM1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc45Q8CIM1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc45Q8CIM1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms