Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Syne4Q8CII8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms