Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ep400Q8CHI8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ep400Q8CHI8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ep400Q8CHI8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms