Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt222Q8CCX5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt222Q8CCX5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt222Q8CCX5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt222Q8CCX5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt222Q8CCX5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt222Q8CCX5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt222Q8CCX5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt222Q8CCX5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt222Q8CCX5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms