Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwa8Q8CC88 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Vwa8Q8CC88 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vwa8Q8CC88 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms