Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb1Q8CBF3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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