Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip1Q8CBD1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms