Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn3Q8CBC6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn3Q8CBC6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms