Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn5Q8CBA2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms