Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rassf4Q8CB96 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf4Q8CB96 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rassf4Q8CB96 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf4Q8CB96 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf4Q8CB96 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf4Q8CB96 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf4Q8CB96 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf4Q8CB96 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rassf4Q8CB96 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rassf4Q8CB96 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rassf4Q8CB96 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.6 ms