Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc5Q8CAL5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms