Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp3Q8C7U1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4bp3Q8C7U1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms