Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnrQ8BYI9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnrQ8BYI9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TnrQ8BYI9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms