Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt3Q8BXF8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms