Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TtpaQ8BWP5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TtpaQ8BWP5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TtpaQ8BWP5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TtpaQ8BWP5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtpaQ8BWP5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TtpaQ8BWP5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TtpaQ8BWP5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms