Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp38Q8BW70 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
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